Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcl11bQ99PV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms