Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lpin3Q99PI4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpin3Q99PI4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms