Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem2Q99NH8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem2Q99NH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms