Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Bco2Q99NF1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bco2Q99NF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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