Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rims1Q99NE5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rims1Q99NE5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms