Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ubqln4Q99NB8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ubqln4Q99NB8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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