Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel1Q99MW3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel1Q99MW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms