Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rnf17Q99MV7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf17Q99MV7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms