Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtpbp4Q99ME9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms