Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp1b4Q99ME6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp1b4Q99ME6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms