Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cstf3Q99LI7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cstf3Q99LI7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms