Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp5lQ99LH9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Sh3bp5lQ99LH9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp5lQ99LH9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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