Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp16Q99LG0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp16Q99LG0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms