Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmp1Q99KU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms