Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab28Q99KL7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab28Q99KL7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms