Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp11Q99K46 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp11Q99K46 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms