Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf11Q99JX1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms