Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctu1Q99J10 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu1Q99J10 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms