Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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