Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim59Q922Y2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim59Q922Y2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms