Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp4Q921I6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms