Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TardbpQ921F2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms