Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Supt16hQ920B9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms