Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csde1Q91W50 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csde1Q91W50 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms