Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp3Q91W36 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp3Q91W36 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms