Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW3

Cacng6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng6Q8VHW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng6Q8VHW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms