Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc71Q8VEG0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc71Q8VEG0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms