Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg8Q8VE18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Smg8Q8VE18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Smg8Q8VE18 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Smg8Q8VE18 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Smg8Q8VE18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg8Q8VE18 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms