Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rapgef3Q8VCC8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgef3Q8VCC8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgef3Q8VCC8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
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