Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Top1mtQ8R4U6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Top1mtQ8R4U6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top1mtQ8R4U6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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