Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a8Q8R4D1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a8Q8R4D1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms