Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00116Q8NCU8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms