Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casc3Q8K3W3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casc3Q8K3W3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms