Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OptnQ8K3K8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OptnQ8K3K8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms