Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk5rap2Q8K389 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms