Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms