Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd2Q8K2Z4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ncapd2Q8K2Z4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms