Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prkd3Q8K1Y2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms