Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms