Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip10Q8CJ53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms