Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SbsnQ8CIT9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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