Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cog3Q8CI04 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms