Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms