Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ep400Q8CHI8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ep400Q8CHI8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms