Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Setd1bQ8CFT2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd1bQ8CFT2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms