Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms