Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc178Q8CDV0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc178Q8CDV0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms