Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms