Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn5Q8CBA2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn5Q8CBA2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms