Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A430089I19RikQ8C9W1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms